Fibroza chistica (mucoviscidoza) - Gena CFTR secventiere NGS

Fibroza chistică este o boală genetică autosomal recesivă, multisistemică, caracterizată prin secreții vâscoase la nivel pulmonar, pancreatic și digestiv, cu evoluție progresivă și impact major asupra funcției respiratorii și nutriționale.

Termen de execuție*

45 zile lucrătoare

Despre analiza genei CFTR – fibroza chistică

Gena CFTR, localizată pe cromozomul 7q31.2, codifică un canal ionic responsabil de transportul clorului la nivelul epiteliilor respirator, digestiv, pancreatic și sudoral. Disfuncția acestui canal determină deshidratarea secrețiilor și formarea mucusului vâscos caracteristic bolii.

Cea mai frecventă mutație asociată este p.Phe508del (F508del), însă există peste 2.000 de variante descrise ale genei CFTR, cu impact variabil asupra funcției proteinei.

Secvențierea NGS permite identificarea:

• mutațiilor punctiforme (SNV)
• inserțiilor și delețiilor mici (INDEL)
• variantelor splice-site
• variantelor patogene rare sau private
• variantelor cu semnificație incertă (VUS)

Afecțiuni sau simptome asociate

Testul este indicat în evaluarea:

• fibrozei chistice (mucoviscidoza)
• infecțiilor respiratorii recurente
• bronșiectaziilor difuze
• tusei cronice productive
• insuficienței pancreatice exocrine
• malabsorbției și malnutriției
• ileusului meconial la nou-născuți
• infertilității masculine (azoospermie obstructivă prin absența canalelor deferente)
• pancreatitei cronice idiopatice
• suspiciunii de boală CFTR-related disorder

Cui se adresează

• pacienților cu suspiciune clinică de fibroză chistică
• nou-născuților cu screening neonatal pozitiv
• copiilor cu infecții respiratorii recurente și stagnare ponderală
• pacienților cu bronșiectazii fără cauză clară
• bărbaților cu infertilitate de cauză obstructivă
• cuplurilor aflate în evaluare preconcepțională
• rudelor de gradul I ale pacienților diagnosticați
• cazurilor cu fenotip atipic CFTR-related

Metodologie de testare

• extracție ADN genomic din sânge periferic EDTA
• secvențiere de nouă generație (NGS) a genei CFTR
• analiză bioinformatică a regiunilor codante și splice
• identificarea:
  • SNV (mutații punctiforme)
  • INDEL (inserții/deleții mici)
  • variante patogene și probabil patogene
• clasificare conform ghidurilor ACMG
• interpretare în corelație cu baza de date Centogene pentru boli rare și cu fenotipul CFTR

Beneficii și importanță clinică

• confirmă diagnosticul molecular al fibrozei chistice
• permite identificarea purtătorilor sănătoși
• contribuie la evaluarea riscului reproductiv în cupluri
• ajută la diagnosticarea formelor atipice sau CFTR-related disorders
• permite consiliere genetică familială corectă
• sprijină deciziile terapeutice și de monitorizare
• facilitează accesul la terapii modulatorii CFTR

Particularități și limitări

• gena CFTR prezintă o mare heterogenitate mutațională (>2000 de variante descrise)
• unele deleții/duplicații mari pot necesita testare complementară (MLPA)
• pot fi identificate variante cu semnificație incertă (VUS)
• un rezultat negativ nu exclude complet diagnosticul în forme rare sau mutații nedetectate prin metoda utilizată
• interpretarea trebuie corelată cu testul funcțional (testul sudorii) și tabloul clinic
• variabilitatea fenotipică poate fi mare chiar între și pacienți cu aceleași mutații

Tip probă și condiții de recoltare

Probă necesară:

• sânge integral EDTA

Volum recomandat:

• 2 × 6 ml sânge periferic

Condiții de recoltare:

• recoltare venoasă standard în vacutainer EDTA
• nu necesită pregătire specială
• transport conform protocolului laboratorului
• recomandată completarea datelor clinice și istoricului familial

Analize asociate recomandate

• Testul sudorii (clor în transpirație) – diagnostic funcțional standard
• Analiza delețiilor/duplicațiilor CFTR (MLPA)
• Panel NGS boli respiratorii genetice
• Elastază pancreatică fecală
• Cultură secreții bronșice
• Testare genetică familială CFTR
• Screening preconcepțional pentru cupluri

Particularitate clinică importantă

Fibroza chistică este una dintre cele mai frecvente boli genetice severe la populația caucaziană. Diagnosticul molecular complet al genei CFTR este esențial nu doar pentru confirmarea bolii, ci și pentru identificarea pacienților eligibili pentru terapii modulatoare CFTR (corectoare și potentiatoare), care pot modifica semnificativ evoluția bolii și calitatea vieții.