Testare MLPA – gena OTC (Deficienta de ornitin-transcarbamilaza)

Deficiența de ornitin-transcarbamilază (OTC) este cea mai frecventă tulburare ereditară a ciclului ureei și este cauzată de modificări ale genei OTC, localizată pe cromozomul X (Xp21.1).

Deși majoritatea cazurilor sunt determinate de mutații punctiforme detectabile prin secvențiere, un procent semnificativ de pacienți prezintă:

• deleții exonice,
• duplicații exonice,
• deleții parțiale ale genei,
• rearanjamente structurale care nu pot fi identificate prin secvențiere convențională.

Analiza MLPA este special concepută pentru detectarea modificărilor de număr de copii (CNV – Copy Number Variants) la nivelul genei OTC.

Deficitul OTC determină afectarea ciclului ureei și acumularea toxică de amoniac în organism, manifestările putând varia de la forme neonatale severe până la forme cu debut tardiv.

Indicații de testare

• Suspiciune clinică de deficiență de ornitin-transcarbamilază
• Hiperamoniemie inexplicabilă
• Rezultat negativ sau neconcludent la secvențierea genei OTC
• Confirmarea unei deleții/duplicații suspectate
• Screening familial după identificarea unei anomalii structurale OTC
• Evaluarea purtătoarelor în familii cu diagnostic confirmat
• Consiliere genetică reproductivă

Cui se adresează

• Nou-născuților cu hiperamoniemie severă
• Copiilor și adulților cu tulburări ale ciclului ureei
• Femeilor cu risc de a fi purtătoare ale unei mutații OTC
• Familiilor cu diagnostic genetic confirmat de deficiență OTC
• Medicilor geneticieni, pediatri, neurologi și specialiștilor în boli metabolice

Metodologie de testare

• Extracție ADN genomic din sânge periferic
• Analiză prin tehnologia MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification)
• Evaluarea tuturor exonilor genei OTC
• Detectarea:
  • delețiilor heterozigote sau hemizigote
  • duplicațiilor exonice
  • delețiilor complete sau parțiale ale genei
  • variațiilor de număr de copii (CNV)
• Interpretare conform ghidurilor ACMG și standardelor internaționale de genetică moleculară

Beneficii și importanță clinică

• Detectează modificări genetice care nu pot fi identificate prin NGS sau secvențiere Sanger
• Completează evaluarea moleculară a genei OTC
• Poate crește rata de diagnostic al deficienței OTC
• Permite identificarea purtătorilor din familie
• Contribuie la managementul precoce al bolii
• Facilitează consilierea genetică și planificarea familială
• Ajută la stabilirea unui diagnostic molecular complet

Analize asociate recomandate

Investigații genetice

• Secvențiere NGS a genei OTC
• Testare țintită familială pentru mutația identificată
• Panel NGS pentru tulburările ciclului ureei
• Exom clinic (WES) în cazurile complexe

Investigații metabolice

• Amoniac plasmatic
• Aminoacizi plasmatici
• Acid orotic urinar
• Acizi organici urinari
• Profil metabolic extins

Evaluare clinică

• Consult genetic
• Consult de boli metabolice
• Evaluare neurologică
• Monitorizarea funcției hepatice

Probă recoltată / condiții analiză

Sânge total EDTA – 2 x 6 ml

• Nu necesită condiții speciale de recoltare

Documente necesare

• Recomandare medicală
• Istoric clinic și metabolic
• Rezultate genetice anterioare (dacă există)
• Raport NGS/Sanger anterior (dacă testarea este complementară)

Denumiri alternative

• OTC MLPA analysis
• OTC deletion/duplication testing
• Ornithine transcarbamylase MLPA
• OTC copy number analysis
• OTC CNV analysis
• OTC gene dosage analysis
• OTC rearrangement testing
• Urea cycle disorder MLPA panel
• OTC exon deletion/duplication test
• OTC gene MLPA assay

Particularități ale testului

Testarea MLPA a genei OTC este destinată identificării delețiilor și duplicațiilor exonice sau genice, modificări care nu sunt detectate în mod optim prin secvențiere standard. Analiza este recomandată în special la pacienții cu suspiciune clinică puternică de deficiență OTC și rezultat negativ la secvențierea genei. Pentru o evaluare genetică completă, se recomandă asocierea cu secvențierea NGS a genei OTC, cele două metode fiind complementare.